微生物基因组学软件开发进阶

(侯圣伟)OCE50442024秋  
2024秋
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选课类别:专业任务 教学语言:中文
课程类别:专业选修课 开课单位:海洋科学与工程系
课程层次:未知 获得学分:3.0
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课程简介(教工部数据)
理论实践课,3学分(2+1),4(2+2)学时/每周。软件开发在生物学各研究领域中的地位越来越重要,熟练掌握生物信息学软件开发可帮助生物学家快速发掘现象背后的生物学机理。目前我们学校尚未开设针对微生物基因组的生物信息学软件开发课程。本课程将教授学生微生物基因组学领域的高级软件开发技术。学生将学习如何使用Python进行基因组学数据分析和可视化,并进一步学习如何基于机器学习和深度学习模型开发基因组学应用软件。学完本课程后,学生将能够掌握使用Python进行微生物基因组学数据分析的基础知识,能够基于机器学习和深度学习模型开发应用于微生物基因组学的生物信息学软件。选修本课程需要对微生物基因组学、命令行和Python编程有基本的了解。


Lecture and practicalcourses, 3 (2+1) credits, 4 (2+2) hours per week. Software development isbecoming increasingly important in the fields of life sciences. Proficiency in bioinformaticssoftware development could help biologists quickly identify underlying biologicalmechanisms behind the scenes. Currently, there is no course covering softwaredevelopment in microbial genomics at SUSTech. This course will introducestudents to the advanced software development techniques in microbial genomics.Students will learn how to use Python to analyze and visualize genomic data andgain experience developing machine-learning and deep-learning models forgenomics applications. Upon completion of this course, students will be able tounderstand the basics of data analysis in microbial genomics using Python, and willbe able to develop advanced bioinformatics software for microbial genomicsbased on machine-learning and deep-learning models. Basic knowledge ofmicrobial genomics and command line, as well as programming experience inPython, is required to attend this course.
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侯圣伟

海洋科学与工程系

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